10x Genomics, Inc. est une entreprise américaine de biotechnologie installée à Pleasanton, en Californie. Elle fournit aux laboratoires des outils pour étudier les mécanismes biologiques à l’échelle de la cellule individuelle et comprendre leur organisation dans les tissus. Son positionnement associe instrumentation, consommables et analyse informatique, avec une clientèle composée notamment d’universités, d’instituts de recherche et de groupes pharmaceutiques. Son site est 10xgenomics.com.
Une entreprise née de l’analyse à haute résolution
Fondée en 2012 par Serge Saxonov, Ben Hindson et Kevin Ness, 10x Genomics s’est développée autour d’un constat : les mesures réalisées sur des mélanges de cellules peuvent masquer des différences biologiques importantes. En distinguant les cellules les unes des autres, les chercheurs peuvent identifier des populations rares, caractériser leurs fonctions et suivre leurs transformations.
Introduite au Nasdaq en 2019, l’entreprise a progressivement élargi son portefeuille au-delà de l’analyse de cellules dissociées. Elle s’est notamment renforcée dans la biologie spatiale, qui vise à conserver l’information sur la position des cellules et des molécules dans un échantillon. Cette évolution rapproche les mesures moléculaires de l’architecture réelle des tissus, un élément déterminant pour interpréter leur fonctionnement.
Trois plateformes pour explorer les cellules et les tissus
La plateforme Chromium permet de préparer des échantillons pour des analyses à cellule unique. Elle repose notamment sur la microfluidique et sur des codes-barres moléculaires permettant d’attribuer les données aux cellules étudiées. Selon les protocoles, les chercheurs peuvent explorer l’expression des gènes, l’accessibilité de la chromatine ou les récepteurs des cellules immunitaires. Le séquençage proprement dit s’effectue sur des équipements compatibles, distincts de ceux de 10x Genomics.
Visium aborde les échantillons sous un autre angle : mesurer l’expression des gènes tout en conservant leur localisation dans des coupes de tissus. Xenium complète cette approche par la détection et la localisation de molécules d’ARN directement dans les tissus, à partir de panels de cibles. Ces outils répondent à des besoins différents de couverture moléculaire, de résolution et de préparation des échantillons.
Les logiciels de traitement et de visualisation accompagnent ces plateformes pour transformer les mesures en résultats interprétables. Le modèle économique combine la vente d’instruments avec celle de réactifs et de consommables nécessaires aux expériences. Ces solutions sont destinées à la recherche ; elles ne constituent pas, par elles-mêmes, des tests de diagnostic clinique.
Et maintenant ?
Pour 10x Genomics, l’enjeu est de rendre ces analyses plus accessibles, reproductibles et intégrables aux pratiques des laboratoires. Leur adoption dépend autant du coût des expériences que de la qualité des échantillons et des compétences bioinformatiques disponibles. Dans un marché concurrentiel, l’entreprise doit aussi démontrer l’intérêt de combiner données cellulaires et spatiales. Le rapprochement de ces lectures pourrait aider à mieux comprendre les interactions entre cellules et à identifier de nouvelles pistes thérapeutiques, sans garantir à lui seul leur traduction en traitements.